Em 1958, a Câmara Municipal de Itajaí se reúne para votar o desmembramento de sua jurisdição dos distritos de Penha, Ilhota e Luís Alves.

No dia 21 de junho foi aprovada a emancipação de Penha, com data marcada para a instalação em 19 de julho. Fora então nomeado Dagoberto Alves Nogueira (17/07/58-02/02/59) como prefeito provisório com a finalidade principal de organizar e promover a eleição que apontaria o primeiro Prefeito eleito. A eleição aconteceu em novembro e fora eleito João Félix de Andrade (02/02/59-09/03/62), que era então Conselheiro do distrito junto ao município de Itajaí. Conhecido como Joca Trajano, ele não fora bem sucedido como prefeito, vindo a ser deposto por Impeachment no terceiro ano de mandato.

Assumiu o presidente da Câmara Francisco Leopoldo Fleith até 10/03/62 passando o cargo para Paulo Fernandes de Oliveira que governou até 31/01/64. Como segundo prefeito eleito assumiu José João Batista em 31/01/64 até 11/05/66 quando veio a falecer no cargo. Até que se promovesse nova eleição, assumiu Osmar Onofre Corrêa (12/05/66 -10/07/66), deixando então o cargo para o interventor Tenente Milton Fonseca (10/07/66-12/12/66). Como terceiro prefeito eleito, assumiu Henrique de Assis (13/12/66-30/01/69. Henrique de Assis foi sucedido por Abelardo Corrêa (31/01/69-30/01/73. Eleito Eugênio Krause (31/01/73- 03/02/75), grande realizador, faleceu no exercício do cargo. Assumiu então o Vice Arão Domingos da Costa (04/02/75-31/01/77) até o final daquela gestão. Daí foi eleito José de Assis (01/02/77- 31/01/83) que governou seis anos no chamado mandato tampão. Clóvis Bergamaschi (01/02/83-31/12/88) veio em seguida também governando seis anos. Sucedido por Sebastião Reis (01/01/89-31/12/92), já com o mandato voltado para quatro anos. Daí se elegeu Julcemar Alcir Coelho (01/01/93-31/12/96. Novamente se elegeu Clóvis Bergamaschi para o mandato 01/01/97-31/12/2000. Julcemar Coelho veio novamente eleito para dois mandatos consecutivos: 01/91/2004 e 01/01/2005-31/12/2008. Daí também fora eleito para dois mandatos consecutivos Evandro dos Navegantes (01/01/2009-31/12/12 e 01/01/13-31/12/16). Tomou posse em 01/01/17 o atual prefeito Aquiles José Schneider da Costa, que está completando o seu primeiro ano de mandato.